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HIV病毒感染并破坏CD4阳性（CD4+）细胞，这是一种免疫细胞，在维持人体免疫系统和对抗疾病方面发挥着关键作用。
也称为T辅助细胞，CD4+细胞负责指导免疫系统的其他细胞执行其特定功能。感染HIV时，受损的CD4+细胞数量越高，免疫系统就越弱，一个人抵抗感染和疾病的能力就越差。最终，这导致了艾滋病的发展。
大多数HIV感染者在出现任何严重症状之前都可以携带病毒数年。如果他们的病情被诊断出来，抗逆转录病毒药物可以帮助降低体内的HIV水平，保护CD4+细胞，从而显著减缓免疫系统被破坏的速度。
从理论上讲，使用这种药物，感染艾滋病毒的人可以在患上艾滋病之前活很长时间。然而，这些药物在资源有限的许多贫穷国家无法获得，来自这些地区的数百万人因无法获得这些药物而死亡。
西方国家的流行病学研究表明，在缺乏抗逆转录病毒药物的情况下，艾滋病毒感染进展为艾滋病的平均时间为10至12年。然而，这一估计基于假定的健康饮食和生活方式，同样，可能不适用于来自经济落后地区的个人，他们可能营养不良，因此有可能更快地死于艾滋病。
此外，研究人员还观察到未经治疗的个体中疾病进展的广泛差异，而诸如特定HIV毒株的毒力水平以及与其他细菌的共同感染等因素被认为会影响疾病进展的速度和严重程度。
在未感染HIV且总体健康的人群中，CD4计数约为每mm3血液800至1200个CD4+细胞。在未接受治疗的感染者中，CD4计数逐渐下降。
一旦低于200，这些人就特别容易患上艾滋病特有的机会性感染和癌症，这是疾病的最后阶段。因此，人们通常被定义为当CD4计数下降到200以下时，或者当他们出现了许多艾滋病定义并发症之一时，已经发展为艾滋病。然而，各国对艾滋病患者的定义略有不同。
艾滋病是一种非常严重的疾病，达到这一疾病阶段的人通常会受到影响眼睛、肺部、胃肠道和许多其他器官的感染。
该病的其他并发症包括严重的体重减轻、腹泻、神经系统疾病和癌症的发展，如卡波西肉瘤和某些形式的淋巴瘤。
